Mūsdienās redzamā Subates luterāņu baznīca iesvētīta 1686. gadā un ir viena no senākajām baznīcām Sēlijā. Celta luterāņiem neraksturīgā bizantiešu stilā ar pieciem tornīšiem.
Sākotnēji luterāņu draudzes dievnams atradies ezera otrā krastā. Subates miesta īpašnieks Gothards Ksavers Zībergs pārgājis katoļticībā un līdz ar viņu arī visi apkārtnes zemnieki. Baznīca nodota katoļiem. Padzītie luterāņi raduši patvērumu Prodes muižas teritorijā, kur tās īpāsnieks H. F. Ostens-Zakens uzcēlis jaunu luterāņu baznīcu un dibinājis Jaunsubates miestu.
Baznīcā saglabājies 17. gadsimtā veidots kokgriezumiem rotāts baroka interjers, kā arī 1853. gadā darinātās ērģeles. Luterāņiem netipiski greznais interjers sastāv no daudzām koka skulptūrām, kas joprojām turas piestiprinātas ar koka tapām.
Aiz baznīcas dārza paveras izcilas ainavas uz Lielo Subates un Mazo Subates ezeru. Rakstot grāmatu “Leišmalīte”, Subati izstaigājis rakstnieks Imants Ziedonis, kurš atzinis šo par vienu no skaistākajām Latvijas skatu vietām. Aiz baznīcas novietotie soliņi ļauj mierpilni izbaudīt krāšņos ezeru skatus, bet par skaistumu atgādina Ziedoņa muzeja uzstādītais uzraksts “Skaisti”.